De nouvelles données relient l’origine de l’épidémie aux chiens viverrins sur un marché de Wuhan

Une équipe internationale de virologues a déclaré jeudi avoir trouvé des données génétiques sur un marché de Wuhan, en Chine, reliant le coronavirus aux chiens viverrins qui y sont vendus, ajoutant à la preuve que la pire pandémie depuis un siècle pourrait avoir été déclenchée. Un animal infecté qui est manipulé par le biais du commerce illégal d’espèces sauvages.

À partir de janvier 2020, des données génétiques ont été prélevées sur des écouvillons prélevés sur le marché de gros des fruits de mer de Huanan et dans les environs, peu de temps après que les autorités chinoises ont fermé le marché en raison de soupçons qu’il était lié à une nouvelle épidémie de virus. À ce moment-là, les animaux avaient été retirés, mais les chercheurs ont frotté les murs, les sols, les cages métalliques et les chariots souvent utilisés pour transporter les animaux.

Dans les échantillons testés positifs pour le coronavirus, l’équipe de recherche internationale a trouvé du matériel génétique appartenant à des animaux, y compris de grandes quantités qui pourraient correspondre à un chien viverrin, ont déclaré trois scientifiques impliqués dans l’analyse.

La combinaison du virus et du matériel génétique d’un animal ne prouve pas qu’un raton laveur a été infecté par un chien. Et même si un chien viverrin est infecté, il n’est pas certain que l’animal ait transmis le virus à l’homme. Un autre animal peut avoir transmis le virus à des humains, ou une personne infectée par le virus peut avoir transmis le virus à un chien viverrin.

Mais l’analyse a montré que des chiens viverrins – des animaux duveteux apparentés aux renards et capables de propager le coronavirus – ont déposé des signatures génétiques au même endroit où se trouve le matériel génétique du virus, ont déclaré les trois scientifiques. Cette preuve, ont-ils dit, correspondait à un scénario dans lequel le virus se propageait d’un animal sauvage à l’homme.

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Un rapport contenant tous les détails des conclusions du Groupe d’étude international n’a pas encore été publié. Leur analyse a été rapportée en premier atlantique.

Bien qu’elles ne résolvent pas la question de savoir comment l’épidémie a commencé, les nouvelles preuves ne manqueront pas de bouleverser le débat sur l’origine de l’épidémie.

Ces dernières semaines, la théorie des fuites de laboratoire selon laquelle le coronavirus a émergé d’un laboratoire de recherche à Wuhan a gagné du terrain grâce à une nouvelle évaluation des renseignements par le département américain de l’énergie et des enquêtes menées par la nouvelle direction républicaine.

Mais les données génétiques du marché fournissent des preuves plus concrètes de la façon dont le virus aurait pu se propager des animaux sauvages en dehors du laboratoire aux humains. Cela suggère également que les scientifiques chinois ont fourni un compte rendu incomplet des preuves qui pourraient fournir des détails sur la propagation du virus sur le marché de Huanan.

Jeremy Kamil, virologue au Louisiana State University Health Sciences Center Shreveport, qui n’a pas participé à l’étude, a déclaré que les résultats montrent que « des échantillons provenant de marchés d’origine précoce de Covid ont été contaminés par des lectures d’ADN d’animaux sauvages ».

Le Dr Kamil a déclaré qu’il y avait peu de preuves concluantes qu’un animal infecté avait déclenché l’épidémie. Mais, a-t-il dit, « cela attire vraiment l’attention sur le commerce illégal d’animaux de manière intime ».

Des scientifiques chinois A étude Février 2022 voit les mêmes modèles de marché. Cette étude a fait état d’échantillons positifs pour le coronavirus, mais a déclaré que le virus provenait de victimes qui faisaient leurs courses ou travaillaient au marché, et non d’animaux qui y étaient vendus.

À un moment donné, les mêmes chercheurs, dont certains affiliés aux Centres chinois de contrôle et de prévention des maladies, ont publié des données brutes d’écouvillons sur le marché à GISAID, un référentiel international de séquences génomiques pour les virus. (Les efforts pour joindre les scientifiques chinois par téléphone jeudi ont été infructueux.)

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Le 4 mars, Florence Debare, biologiste de l’évolution au Centre national français de la recherche scientifique, cherchait dans la base de données des informations relatives au marché de Huanan lorsqu’elle a remarqué dans une interview que plus de séquences que d’habitude apparaissaient. Au début, le Dr était confus quant à savoir s’ils contenaient de nouvelles données. Debare les a rangés, se reconnectant la semaine dernière pour découvrir qu’ils avaient une collection de données brutes.

Les experts en virus attendent avec impatience ces données de séquence brutes du marché depuis qu’ils ont appris leur existence dans un rapport chinois de février 2022. Le Dr Debare a déclaré avoir alerté d’autres scientifiques, y compris les dirigeants du groupe qui a publié la dernière série d’études. Année indiquant l’origine du marché.

Une équipe internationale – comprenant Michael Worobe, un biologiste de l’évolution à l’Université de l’Arizona ; Christian Anderson, virologue au Scripps Research Institute en Californie ; et Edward Holmes, biologiste à l’Université de Sydney, ont commencé à exploiter les nouvelles données génétiques la semaine dernière.

Un modèle en particulier a retenu leur attention. Les scientifiques impliqués dans l’analyse ont déclaré qu’il avait été prélevé sur un chariot attaché à un étal particulier du marché de Huanan visité par le Dr Holmes en 2014. Ce stand, a découvert le Dr Holmes, avait des chiens viverrins en cage au-dessus d’une cage séparée qui abritait les oiseaux, un environnement idéal pour la propagation de nouveaux virus.

Un écouvillon prélevé sur une charrette au début de 2020 contenait du matériel génétique du virus et un chien viverrin, a découvert l’équipe de recherche.

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« Dans l’un de ces échantillons, nous avons pu découvrir assez rapidement qu’il y avait beaucoup d’acide nucléique de chien viverrin avec l’acide nucléique viral », a déclaré Stephen Goldstein, virologue à l’Université de l’Utah. Une nouvelle analyse. (Les acides nucléiques sont les blocs de construction chimiques qui transportent l’information génétique.)

Après que l’équipe internationale soit tombée sur les nouvelles données, elle a approché les chercheurs chinois qui avaient téléchargé les fichiers avec une offre de coopération, selon les règles du référentiel en ligne, ont déclaré les scientifiques impliqués dans la nouvelle analyse. Après cela, les images ont disparu du GISAID.

On ne sait pas qui les a enlevés et pourquoi.

Le Dr Debare a déclaré que l’équipe de recherche est à la recherche de plus de données, y compris certaines provenant d’échantillons de marché qui ne sont pas toujours rendus publics. « La clé est d’avoir plus de données », a-t-il déclaré.

Les scientifiques impliqués dans l’étude ont déclaré que certains des échantillons contenaient également du matériel génétique d’autres animaux et humains. Angela Rasmussen, virologue à l’Institut des vaccins et des maladies infectieuses de l’Université de la Saskatchewan au Canada, a déclaré que le matériel génétique humain devrait être attendu parce que les gens y font leurs courses et y travaillent. Connecté au marché.

Le Dr Goldstein a également averti : « Nous n’avons pas d’animal infecté et nous ne pouvons pas prouver de manière définitive qu’il y avait un animal infecté dans cette stalle. » Le matériel génétique du virus est suffisamment stable pour qu’on ne sache pas quand il a été mis sur le marché, a-t-il déclaré. Il a déclaré que l’équipe analysait toujours les données et n’avait pas l’intention de rendre son analyse publique avant de publier le rapport.

« Mais », a-t-il dit, « c’est aussi bien que nous pouvons l’espérer, car les animaux du marché n’ont pas été échantillonnés à l’époque ».

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